Mots clés

Infections multiples, Multirésistances, Complexes parasitaires, Ecologie, Génétique, Physiologie, Epidémiologie, Gestion intégrée

Contexte et enjeux

• Préserver durablement la santé des cultures sans recours massif aux pesticides.
• Exploiter les ressources de l’écologie scientifique pour gérer durablement des complexes parasitaires.
• Valoriser la biodiversité végétale.

Questions et axes de recherche

Les cultures sont soumises à des infections multiples, synchrones ou successives, lors de leur cycle vital. Ces infections multiples sont dues à des complexes de bioagresseurs de composition variable dans le temps et l’espace, incluant des espèces ou pathotypes différant par leurs caractéristiques écologiques, et dépendant des systèmes de culture. Elles affectent directement la quantité et la qualité des récoltes.

Or, les méthodes actuelles de lutte sont trop souvent centrées sur un unique bioagresseur, et négligent les multi-infections. La maîtrise durable des multi-infections est donc un front de science et un défi majeur pour une gestion intégrée de la santé végétale.

L’objectif général de l’équipe MIR est donc de gérer durablement les multi-infections et les complexes pathogènes via les différents leviers offerts par la plante hôte elle-même : résistance génétique, architecture, défenses induites, associations végétales.  Le projet s’articule donc autour de deux axes de connaissance : écologie et dynamique des multi-infections d’une part, caractérisation et exploitation des multirésistances (définies comme les caractéristiques des plantes ou des couverts permettant de limiter le développement épidémique de bioagresseurs en conditions de multi-infections) d’autre part. Ces deux axes de connaissance sont étroitement interfacés par la prise en compte des conditions et des conséquences de déploiement des multirésistances au sein de systèmes de production.

Pour adresser cet objectif, nos activités s’articulent autour de trois grandes questions de recherche, fortement interconnectées :

• Quels sont les déterminants biologiques et les règles d’assemblage des complexes parasitaires ?
• Comment ces complexes évoluent- t-’ils selon les caractéristiques des hôtes, et impactent-ils l’expression des résistances des hôtes ?
• Comment ces complexes évoluent- t-’ils selon les caractéristiques des hôtes, et impactent-ils l’expression des résistances des hôtes ?
• Quels leviers, seuls ou combinés, mobiliser pour gérer durablement ces complexes parasitaires, et comment les optimiser ?

Modèles, outils, méthodes, compétences

Objets biologiques 

Hôtes : pomme de terre, légumineuses à graines, associations végétales
Bioagresseurs : champignons, oomycètes, bactéries, virus, nématodes, insectes

Outils et méthodes

MIR associe des compétences en génétique de la plante (génétique de liaison et d’association) et en pathologie végétale, épidémiologie et écologie parasitaire, lui permettant de développer des projets fortement pluridisciplinaires.

Génétique : cartographie, marqueurs moléculaires, génétique des populations
Physiologie : expression gènes de défense et résistance induite
Microbiologie : isolements, co inoculations, phénotypage
Epidémiologie : epidémiosurveillance, expérimentation, modélisation (collaborations Démécologie)
Ecologie des communautés : expérimentation microcosmes, modélisation, statistiques

Concepts

One Health – un seul monde, une seule santé.
Protection intégrée de la santé des cultures (Integrated Crop Health management).